晴朗时节，江户川(㊙)柯南（高(💪)山南(🎾) 配音）和(🥫)毛利(lì )小五郎（小(🕙)山(shān )力也 配音(yīn )）、小(🥕)兰（山崎和佳奈(⚾) 配音）以(yǐ )及少年侦探团(tuán )的伙伴们一同来到京都，他(tā )们即将登(dēng )(🐨)上自卫队(duì )的宙斯盾战舰，体(tǐ )验一把出海(💿)作(🎥)战的(🈺)感觉，期(qī )间还(hái )结识了美(měi )丽又有着(zhe )几分神(🥅)秘(mì )的女自卫队员藤(🔎)井七(qī )海（(👄)柴咲幸(xìng ) 配音）(🚡)。谁知快乐的氛围很(hěn )(👛)快被恐慌所替代，战舰(👚)上突然(👩)发现一条断掉(diào )的手(shǒu )臂，消失的(🍹)自(zì )(⛴)卫(🏸)队员(yuán )又(yòu )引(yǐn )起军(🔮)方的恐(kǒng )慌与(yǔ )猜测(🌲)。原(🈂)来某国神秘间谍X已悄悄(qiāo )登上宙斯盾(🛌)，伺(sì )机盗(🚓)取战舰上的绝(jué )密情报(🏆)。
　　为了(🙎)找(zhǎo )出隐藏的对手，柯(🌻)南和灰原哀（林原惠(huì )美(měi ) 配音）、阿笠(lì )博士（(🌛)绪(🔉)方贤一 配音）、(🐋)服部(🈵)平次(🏌)（(🏁)堀川(chuān )亮(liàng ) 配(pèi )音(🏃)）以及远山(🍄)和(😞)叶（宫(gōng )村优(🥏)子(🕳) 配(🧗)音）通力合作，与间谍展开连番斗(dòu )智斗(🐩)勇的(de )较(jiào )量…